二甲中学创办于1956年，1958年开设高中部，2006年7月升格为江苏省三星级普通高中。校园占地48024平方米，总建筑面积36322平方米，学校固定资产2808.83万元。近年来，学校高标准进行现代教育装备基础建设，呈现出极为可喜的跨跃式发展态势。
学校大力推行“生命化教育”理念下的“学校行为文化建设”，10月24日，《中国教育报》整版报道《“今天第二”的精神品质——江苏省南通市通州区二甲中学“学校行为文化建设”解读》。二甲中学先后还被《红旗文稿》、《人民教育》、《中国教育学刊》、《语言文字报》等媒体深度报道，已在全国取得一定影响。
学校现有学生2544人，其中高中部24个班，1414人，初中部20个班，1130人。学校共有教职工185人，专任教师147人，教师综合素质普遍较高。
学校教育信息化建设全面达标，有计算机网络教室3个，计算机158台，计算机资料及工作室、软件制作室1个；校园网络管理中心1个，校园闭路电视系统1个，校园广播系统1个，学校安全监控系统1个；建有电子备课室1个，计算机20台，各办公室至少配有计算机1台，共58台，师机比达2：1。
学校现有理化生实验室8个（其中物理3个、化学3个、生物2个），仪器室3个（物理2个、化学1个），标本室1个，准备室3个（理、化、生各1个），药品室1个，危险药品柜1个。美术教室2个，音乐教室2个，舞蹈教室1个，地理历史教室2个，通用技术教室1个。
学校图书馆总面积3080平方米,其中设有阅览室3个,分别为教师阅览室、学生杂志阅览室和电子阅览室。藏书81228册，其中纸质图书77628册，电子图书240片（折合3600册图书）。阅览室有影像资料829盘，涉及16个学科，各类期刊207种。各类相关配套设施齐全。
二甲中学认为“教育现代化，关键是人的现代化；人的现代化，关键在理念的现代化。” 学校大力促进教师队伍建设的现代化，进行电子白板、课件制作的培训，鼓励教师开通个人博客，学校建有“教育行者”博客圈和QQ群，为教师交流提升奠定了信息化基础；学校在图书馆大厅设置开放式触摸屏电脑5台，供学生随时上网查询信息，培养学生良好的信息素养。
二甲中学先后获得“江苏省德育先进学校”、“江苏省绿色学校”、“全国第八届中小学思想道德建设先进学校”、“全国特色语文示范校”、“全国作文教学先进单位”、“江苏省科技教育先进学校”、“南通市特色学校”、“南通市最安全学校”、“南通市教育系统先进集体”、“南通市青少年行为规范学校”等六十多项国家级、省级和市级荣誉。
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